该仪器具有两套独立的系统： 正置单光子激光共聚焦显微镜： a. 配置4个长寿命6条激发光谱线: 405nm、458nm、488nm、515nm、559nm、635nm。 b. 4个荧光发射光检测通道（3个光谱型、1个滤片型），1个明场透射光微分干涉通道。 c. SIM同步光刺激系统（荧光漂泊、恢复研究；荧光共振能量转移研究）。 正置双光子激光显微镜： a. 红外飞秒脉冲激光光源一套，配备群组波长色散补偿系统，波长范围690-1040nm； b. 水镜一套，包括全球最大数值孔径的25倍水镜； c. 4个NDD检测器。可进行较厚标本或活体动物局部组织的荧光成像检测，检测深度可达400-600um。